站址在安徽省合肥市站前路，邮政编码230011。新站建于1997年。离九江站325公里，隶属上海铁路局蚌埠铁路分局管辖。现为一等站。客运：办理旅客乘降；行李、包裹托运。货运：办理整车、零担、集装箱货物发到；办理整车货物承运前保管；不办理整车爆炸品及整车一级氧化剂发到。
合肥是一座有2000多年历史的古城，素以“三国故地，包拯家乡”而闻名海内外。自东汉末以来，合肥为州郡治所，一直是江淮地区重要的行政中心和军事重镇。
合肥素有“淮右襟喉，江南唇齿”之称，交通位置十分重要。合肥站始建于1935年，1936年4月完工。1936年，淮南矿至合肥的铁路试车成功，合肥火车站正式开展铁路旅客运输业务。但是好景不长，1937年10月，为配合抗日战争需要，淮南线被毁，合肥站随之关闭。1942年，日本侵略者修复水家湖至合肥段铁路，合肥站改名为庐江驿恢复启用。1944年日军拆除水家湖至裕溪口段铁路，合肥站再次关闭。抗战时因“兵火破坏，站房、铁轨及一切设备悉无幸存”。解放以后，国家投巨资修复淮南线铁路，1950年11月，合肥至裕溪口段铁路通车，合肥铁路运输恢复。1950年，1、2号站台、站前广场、候车室建成启用。 新中国成立后，1952年，合肥成为安徽省省会，城市人口不断增长，城市规模迅速扩张，老火车站站房小，候车人多拥挤不堪，已不能适应城市发展的需要。
1977年，在合肥城市总体规划编制过程中，计划把合肥原有火车站和铁路向城外移，解决铁路分割城市问题。1982年，国务院批准了合肥市的总体规划。1989年，铁道部下达《关于变更合肥站址方案的批复》文件，合肥铁路枢纽及合肥新客站也列入国家计划，但因建设资金问题，建设工程开工延迟。
合肥新客站于1994年6月开工，1995年底建成竣工，增加了股道，新建了牵出线、候车室、售票厅、行李房、站台雨棚，扩建了货场、仓库。这时的合肥站已经发展成为客货运一等站。
1997年4月1日，合肥新客站通车运营，主站房呈金字塔式设计，外观装饰碧蓝色的玻璃门窗，宛如一颗明珠镶嵌在合肥市城东。
建成后的新客站总面积33182平方米，主站房分上下两层， 六个候车大厅配有中央空调，可同时容纳8000名旅客候车。。售票大厅采用微机售票，行李房最大日运输量近3000件。车站设有旅客导向、多媒体查询系统，使旅客候车和乘降更加方便。车站日接发列车39对以上。2005年，车站发送旅客561万人，发送货物128.5万吨。合宁高速铁路已于2008年通车。合肥站已扩建至9个站台。旅客乘车将更加方便。
与很多城市火车站不同，合肥新客站的建设，一开始就与“新城区”连在一起。为此，合肥市政府特地成立了合肥市新火车站建设区。1995年4月，该建设区升级为新合肥站综合开发试验区，并于1996年2月被建设部批准为全国城市综合开发试点区。为新站专门成立一个新城区，可见合肥站对改变城市面貌所起到的重要作用。合肥站已成为城市发展的新坐标，记录在合肥城市发展变迁的历史档案中。
《铁道部、安徽省人民政府关于安徽省“十一五”铁路建设有关问题会谈纪要》为合肥市铁路未来的发展描绘了新的蓝图：建成以合肥市为中心的铁路枢纽，确立合肥连接东部与中西部的重要铁路枢纽地位，合宁高速铁路 （合肥至南京）、合武高速铁路（合肥至武汉）、京福高速铁路(合肥至福州) 等铁路通道将交会合肥市。到那时，合肥市建设的历史档案中，合肥站又会留下辉煌的新一页。
1978年合肥站开通开往北京的128次列车.这是安徽省历史上的第一班始发进京列车.也就是今天的T64次列车.
2008年8月1日，合宁铁路将正式运营合肥至南京、上海的5对动车组列车，这将是合肥站首次接发的动车组。它们分别为合肥至上海列车为D477、D481、D485次，合肥至南京列车为D491、D495次。